Si tratta della sala dove i monaci consumavano i pasti; del resto a Polirone, all’incirca nel 1478, nell’ambito del complesso monastico, venne addirittura edificato un edificio autonomo con questo scopo: un ampio salone diviso in quattro campate, coperte (in epoca forse di poco posteriore) da volte a crociera. I monaci vi accedevano dal lato est, ovvero dal chiostro maggiore, transitando per un vestibolo dotato di una grande fontana. Nel 1510 Gregorio Cortese decise di decorare tutta la parete ovest e chiamò per questo lavoro due artisti: il veronese Girolamo Bonsignori, che dipinse l’Ultima Cena su una tela incastrata nel muro (oggi conservata nel Museo Civico di Badia Polesine), e il giovane Antonio Allegri, detto Il Correggio, che affrescò l’Architettura dipinta in cui si immaginava inserito il Cenacolo. La decorazione della sala venne eseguita fra il 1513 e il 1514. Attualmente il Refettorio ospita il Museo dell’Abbazia. Vi sono esposte testimonianze e reperti archeologici dell’antico cenobio, databili dall’età romana al Rinascimento, ceramiche conventuali, sculture, frammenti di architrave e alcuni materiali fittili e lapidei particolarmente preziosi, tra cui un altorilievo in marmo greco, con i mesi di Novembre e Dicembre attribuiti a Wiligelmo o alla sua scuola, provenienti dal portale della chiesa romanica.